Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms