Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00312Q9Y6C7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms