Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms