Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNPO3Q9Y5L0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms