Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms