Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP8A1Q9Y2Q0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP8A1Q9Y2Q0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms