Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms