Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms