Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms