Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF8Q9UPP1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms