Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF2Q9UNY4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms