Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms