Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
INO80Q9ULG1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms