Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
STAG3Q9UJ98 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STAG3Q9UJ98 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms