Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS51Q9UID3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms