Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFMBT1Q9UHJ3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms