Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms