Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNMT3BQ9UBC3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms