Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC17A7Q9P2U7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms