Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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