Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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