Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms