Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM106BQ9NUM4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM106BQ9NUM4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms