Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms