Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms