Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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HOXD1Q9GZZ0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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HOXD1Q9GZZ0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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HOXD1Q9GZZ0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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