Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms