Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZYG11BQ9C0D3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms