Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM3Q9BZL3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms