Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUS3Q9BZE2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms