Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms