Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms