Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDCA4Q9BXL8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDCA4Q9BXL8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms