Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP3Q9BWW4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP3Q9BWW4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP3Q9BWW4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP3Q9BWW4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP3Q9BWW4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP3Q9BWW4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP3Q9BWW4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP3Q9BWW4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP3Q9BWW4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms