Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms