Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms