Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms