Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms