Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms