Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms