Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms