Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms