Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
AKAP9Q99996 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKAP9Q99996 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms