Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms