Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms