Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms