Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPA33Q99795 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPA33Q99795 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms