Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms