Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP4Q96P64 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP4Q96P64 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms