Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI9

AGBL1, Cytosolic carboxypeptidase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL1Q96MI9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AGBL1Q96MI9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL1Q96MI9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms